iva

DOI:10.18129 / B9.bioc.IVAS

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅iva。

识别影响选择性剪接的基因变异

Bioconductor版本:3.13

识别影响选择性剪接的基因变异。

作者:Seonggyun汉,Sangsoo金

维护人员:Seonggyun韩寒< hangost在ssu.ac.kr >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(iva)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (iva)

PDF	R脚本	iva:识别影响选择性剪接的基因变异
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,GeneRegulation,ImmunoOncology,RNASeq,回归,单核苷酸多态性,测序,软件,转录
版本	2.12.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(6.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> 3.0.0),GenomicFeatures,ggplot2,Biobase
进口	doParallel,lme4,BiocGenerics,GenomicRanges,IRanges,foreach,AnnotationDbi,S4Vectors,GenomeInfoDb,ggfortify、grDevices、方法矩阵,BiocParallel跑龙套,统计数据
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	ima
进口我	ASpediaFI
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	IVAS_2.12.0.tar.gz
Windows二进制	IVAS_2.12.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	IVAS_2.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IVAS
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ iva
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/IVAS/
包下载报告	下载数据