此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见检查.
Bioconductor版本:3.13
INSPEcT(从转录组数据中推断合成、处理和降解率)RNA-seq数据在时间过程实验或稳态条件下,有或没有新生RNA数据的支持。
作者:Stefano de Pretis
维护人员:Stefano de Pretis
引文(从R内,输入引用(“检查”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("INSPEcT")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“检查”)
超文本标记语言 | R脚本 | 从转录组数据推断合成、处理和降解率 |
超文本标记语言 | R脚本 | INSPEcT_GUI.html |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneRegulation,RNASeq,测序,软件,SystemsBiology,TimeCourse |
版本 | 1.22.0 |
在Bioconductor | BioC 3.2 (R-3.2)(6年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R(>= 3.6),方法,Biobase,BiocParallel |
进口 | pROC,deSolve,rootSolve,KernSmooth,gdata,GenomicFeatures,GenomicRanges,IRanges,BiocGenerics,GenomicAlignments,Rsamtools,S4Vectors,GenomeInfoDb,DESeq2,plgem,rtracklayer,SummarizedExperiment,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,闪亮的 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | INSPEcT_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | INSPEcT_1.22.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | INSPEcT_1.22.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/INSPEcT |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/INSPEcT |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/INSPEcT/ |
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