此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见HDF5Array.
Bioconductor版本:3.13
实现HDF5Array, H5SparseMatrix, H5ADMatrix和TENxMatrix类,4个方便和内存高效的数组类容器,用于表示和操作:(1)传统的(也就是密集的)HDF5数据集,(2)HDF5稀疏矩阵(存储在CSR/CSC/Yale格式),(3)h5ad文件的中心矩阵(或/layers组中的任何矩阵),或(4)10x基因组稀疏矩阵。所有这些容器都是DelayedArray扩展,因此支持DelayedArray对象支持的所有操作(延迟或块处理)。
作者:Hervé Pagès
维护者:Hervé Pagès
引文(从R内,输入引用(“HDF5Array”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | HDF5Array_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | HDF5Array_1.20.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | HDF5Array_1.20.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HDF5Array |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HDF5Array |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/HDF5Array/ |
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