GeneGeneInteR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GeneGeneInteR

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GeneGeneInteR

工具测试基因基因在基因层面的交流

Bioconductor版本:3.13

这个包的目的是提出几种方法病例对照关联研究的基因基因交互测试。这种测试可以通过聚合SNP-SNP SNP级别的交互测试执行(SSI)或通过使用基因基因multidimensionnal方法(GGI)方法。包还提出了工具的图形显示结果。

作者:马修艾米丽(aut (cre),尼古拉斯Sounac[所有],Florian Kroell[所有],Magalie Houee-Bigot (aut)

维护人员:马修艾米丽<马修。艾米丽在agrocampus-ouest.fr >

从内部引用(R,回车引用(“GeneGeneInteR”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GeneGeneInteR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GeneGeneInteR”)

PDF R脚本 GeneGeneInteR介绍
PDF R脚本 两两交互测试
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneticVariability,遗传学,GenomeWideAssociation,单核苷酸多态性,软件
版本 1.18.0
Bioconductor自 BioC 3.4 (r - 3.3)(5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 4.0)
进口 snpStats,mvtnorm,Rsamtools,igraph,kernlab,FactoMineR,IRanges,GenomicRanges,data.tablegrDevices图形,统计,跑龙套,方法
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 GeneGeneInteR_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 GeneGeneInteR_1.18.0.zip
macOS 10.13(高山脉) GeneGeneInteR_1.18.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneGeneInteR
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GeneGeneInteR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GeneGeneInteR/
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