GeneExpressionSignature

DOI:10.18129 / B9.bioc.GeneExpressionSignature

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GeneExpressionSignature。

基于基因表达特征的相似性度量

Bioconductor版本:3.13

这个包提供了实现基因表达特征及其距离。基因表达签名表示为一系列基因的表达与感兴趣的生物状态。和它的距离是使用非参数定义,rank-based模式匹配策略基于Kolmogorov-Smirnov统计。基因表达特征及其距离可以用来检测相似药物的签名中,疾病,和生物的兴趣。

作者:杨曹(aut (cre),范李[所有],陆汉(施)

维护人员:杨曹< yiluheihei gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GeneExpressionSignature”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GeneExpressionSignature”)

HTML	R脚本	GeneExpressionSignature
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,软件
版本	1.38.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(10年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 4.0)
进口	Biobase、统计数据、方法
链接
建议	apcluster,GEOquery,knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/yiluheihei/GeneExpressionSignature
BugReports	https://github.com/yiluheihei/GeneExpressionSignature/issues/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GeneExpressionSignature_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	GeneExpressionSignature_1.38.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	GeneExpressionSignature_1.38.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneExpressionSignature
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GeneExpressionSignature
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GeneExpressionSignature/
包下载报告	下载数据