GeneExpressionSignature

DOI:10.18129 / B9.bioc.GeneExpressionSignature

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GeneExpressionSignature

基于基因表达特征的相似性度量

Bioconductor版本:3.13

这个包提供了实现基因表达特征及其距离。基因表达签名表示为一系列基因的表达与感兴趣的生物状态。和它的距离是使用非参数定义,rank-based模式匹配策略基于Kolmogorov-Smirnov统计。基因表达特征及其距离可以用来检测相似药物的签名中,疾病,和生物的兴趣。

作者:杨曹(aut (cre),范李[所有],陆汉(施)

维护人员:杨曹< yiluheihei gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“GeneExpressionSignature”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GeneExpressionSignature”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GeneExpressionSignature”)

HTML R脚本 GeneExpressionSignature
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpression,软件
版本 1.38.0
Bioconductor自 BioC 2.9 (r - 2.14)(10年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 4.0)
进口 Biobase、统计数据、方法
链接
建议 apcluster,GEOquery,knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/yiluheihei/GeneExpressionSignature
BugReports https://github.com/yiluheihei/GeneExpressionSignature/issues/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 GeneExpressionSignature_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 GeneExpressionSignature_1.38.0.zip
macOS 10.13(高山脉) GeneExpressionSignature_1.38.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneExpressionSignature
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GeneExpressionSignature
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GeneExpressionSignature/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网