GOsummaries

DOI:10.18129 / B9.bioc.GOsummaries

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见GOsummaries

GO富集分析的词云摘要

Bioconductor版本:3.13

一个包,用于可视化基因本体论(GO)富集分析结果的基因列表从不同的分析,如聚类或主成分分析。重要的GO类别被可视化为词云,可以与总结底层数据的不同图表相结合。

作者:Raivo Kolde < Raivo。Kolde在eestie .ee>

维护者:Raivo Kolde < Raivo。Kolde在eestie .ee>

引文(从R内,输入引用(“GOsummaries”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("GOsummaries")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GOsummaries”)

PDF R脚本 GOsummaries基础知识
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 聚类GeneExpression软件可视化
版本 2.28.0
在Bioconductor bio3.0 (R-3.1)(7年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.15),Rcpp
进口 plyr、网格gProfileRreshape2limmaggplot2gtable
链接 Rcpp
建议 素食主义者
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/raivokolde/GOsummaries
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 GOsummaries_2.28.0.tar.gz
Windows二进制 GOsummaries_2.28.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) GOsummaries_2.28.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOsummaries
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GOsummaries
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GOsummaries/
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