此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见GOsummaries.
Bioconductor版本:3.13
一个包,用于可视化基因本体论(GO)富集分析结果的基因列表从不同的分析,如聚类或主成分分析。重要的GO类别被可视化为词云,可以与总结底层数据的不同图表相结合。
作者:Raivo Kolde < Raivo。Kolde在eestie .ee>
维护者:Raivo Kolde < Raivo。Kolde在eestie .ee>
引文(从R内,输入引用(“GOsummaries”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("GOsummaries")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GOsummaries”)
R脚本 | GOsummaries基础知识 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 聚类,去,GeneExpression,软件,可视化 |
版本 | 2.28.0 |
在Bioconductor | bio3.0 (R-3.1)(7年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.15),Rcpp |
进口 | plyr、网格gProfileR,reshape2,limma,ggplot2,gtable |
链接 | Rcpp |
建议 | 素食主义者 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/raivokolde/GOsummaries |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | GOsummaries_2.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | GOsummaries_2.28.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | GOsummaries_2.28.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOsummaries |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GOsummaries |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GOsummaries/ |
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