FindMyFriends

DOI:10.18129 / B9.bioc.FindMyFriends

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见FindMyFriends．

微生物比较基因组学研究

Bioconductor版本:3.13

在r中进行微生物比较基因组学的框架。该软件包的主要目的是协助创建泛基因组矩阵，其中来自相关生物的基因按相似性分组，以及对这些数据的分析。FindMyFriends提供了许多新颖的方法来进行泛基因组分析，并支持线性扩展的基因分组算法，从而使创建巨大的泛基因组变得可行。

作者:Thomas Lin Pedersen

维护者:Thomas Lin Pedersen

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("FindMyFriends")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“FindMyFriends”)

超文本标记语言	R脚本	使用FindMyFriends创建泛基因组
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，ComparativeGenomics，DataRepresentation，GenomicVariation，GraphAndNetwork，SequenceMatching，软件
版本	1.22.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(6年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于
进口	方法,BiocGenerics，Biobase、工具、dplyr，IRanges，Biostrings，S4Vectors，烤肉串，igraph，矩阵，消化，filehash，Rcpp，ggplot2，gtable、网格reshape2，ggdendro，BiocParallel， utils，统计
链接	Rcpp
建议	BiocStyle，testthat，knitr，rmarkdown，reutils
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/thomasp85/FindMyFriends
BugReports	https://github.com/thomasp85/FindMyFriends/issues
全靠我
进口我	PanVizGenerator
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	FindMyFriends_1.22.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	FindMyFriends_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FindMyFriends
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/FindMyFriends
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/FindMyFriends/
软件包下载报告	下载数据