ExperimentSubset

DOI:10.18129 / B9.bioc.ExperimentSubset

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见ExperimentSubset

使用Bioconductor实验对象管理数据子集

Bioconductor版本:3.13

实验对象(如summarizeexperiment或singlecel实验)是一个或多个类似矩阵的测试以及相关的行和列数据的数据容器。下游分析通常只需要原始数据的一个子集。例如,过滤出质量差的样品需要在分析之前排除一些列。experiment子集对象是一个容器,用于有效地管理相同数据的不同子集,而不必为每个新子集创建单独的对象。

作者:Irzam Sarfraz [aut, cre],穆罕默德·阿西夫[aut, ths]——约书亚·d·坎贝尔[au]

维护者:Irzam Sarfraz

引文(从R内,输入引用(“ExperimentSubset”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ExperimentSubset”)

超文本标记语言 R脚本 experiment子集类的介绍
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews DataImportDataRepresentation基础设施软件
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.12 (R-4.0)(1年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 4.0.0),SummarizedExperimentSingleCellExperimentSpatialExperimentTreeSummarizedExperiment
进口 方法,矩阵S4Vectors
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdowntestthatcovr统计数据,食物scdsTENxPBMCData气道
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 ExperimentSubset_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 ExperimentSubset_1.2.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) ExperimentSubset_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExperimentSubset
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ experiment子集
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ExperimentSubset/
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