EpiTxDb

DOI:10.18129 / B9.bioc.EpiTxDb

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅EpiTxDb。

存储和访问使用AnnotationDbi epitranscriptomic信息界面

Bioconductor版本:3.13

EpiTxDb促进epitranscriptomic信息的存储。更具体地说,它可以跟踪修改身份,地位,介绍它的酶RNA,说明符决定要修改的RNA上的位置和每个修改与文献引用。

作者:Felix通用恩斯特(aut (cre)

维修工:Felix通用恩斯特< felix.gm。恩斯特在outlook.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“EpiTxDb”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“EpiTxDb”)

HTML	R脚本	EpiTxDb
HTML	R脚本	EpiTxDb-creation
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	Epitranscriptomics,软件
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.0),AnnotationDbi,Modstrings
进口	方法,跑龙套,httr,xml2,旋度,GenomicFeatures,GenomicRanges,GenomeInfoDb,BiocGenerics,BiocFileCache,S4Vectors,IRanges,RSQLite,DBI,Biostrings,tRNAdbImport
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,httptest,AnnotationHub,ensembldb,ggplot2,EpiTxDb.Hs.hg38,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38,BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/FelixErnst/EpiTxDb
BugReports	https://github.com/FelixErnst/EpiTxDb/issues
取决于我	EpiTxDb.Hs.hg38,EpiTxDb.Mm.mm10,EpiTxDb.Sc.sacCer3
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	EpiTxDb_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	EpiTxDb_1.4.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	EpiTxDb_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EpiTxDb
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ EpiTxDb
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EpiTxDb/
包下载报告	下载数据