ERSSA

DOI:10.18129 / B9.bioc.ERSSA

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ERSSA。

实证RNA-seq样本容量分析

Bioconductor版本:3.13

ERSSA包需要用户提供RNA-seq微分表达式的数据集和计算的数量差异表达基因在不同生物复制水平。这允许用户来决定,而不依赖任何先验假设,足够的微分检测是否已经获得RNA-seq数据集。

作者:Zixuan邵(aut (cre)

维护人员:Zixuan邵< Zixuanshao。扎克:gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ERSSA”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ERSSA”)

HTML	R脚本	ERSSA方案介绍
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,MultipleComparison,质量控制,RNASeq,软件,转录
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(3年)
许可证	GPL-3 |文件许可证
取决于	R (> = 4.0.0)
进口	刨边机(> = 3.23.3),DESeq2(> = 1.21.16),ggplot2(> = 3.0.0),RColorBrewer(> = 1.1 - 2),plyr(> = 1.8.4),BiocParallel(> = 1.15.8)、grDevices统计,跑龙套
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/zshao1/ERSSA
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ERSSA_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	ERSSA_1.10.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	ERSSA_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ERSSA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ERSSA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ERSSA/
包下载报告	下载数据