ENmix

DOI:10.18129 / B9.bioc.ENmix

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见ENmix．

Illumina DNA甲基化BeadChip的质量控制和分析工具

Bioconductor版本:3.13

Illumina DNA甲基化阵列的质量控制、分析和可视化工具包。

作者:徐宗礼[cre, aut]，牛良[aut]， Jack Taylor [ctb]

维护者:徐宗丽

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("ENmix")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ENmix”)

PDF	R脚本	ENmix用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect，DNAMethylation，DataImport，DifferentialMethylation，表观遗传学，ImmunoOncology，MethylationArray，微阵列，多通道，归一化，OneChannel，预处理，PrincipalComponent，质量控制，回归，软件，TwoChannel
版本	1.28.8
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	平行,doParallel，foreach，SummarizedExperiment,统计数据
进口	grDevices、图形preprocessCore，matrixStats，方法，utils，irr，geneplotter，嫁祸于，minfi，RPMM，illuminaio，dynamicTreeCut，IRanges，gtools，Biobase，ExperimentHub，AnnotationHub，genefilter，gplots，quadprog，S4Vectors
链接
建议	minfiData，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ENmix_1.28.8.tar.gz
Windows二进制	ENmix_1.28.8.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ENmix_1.28.8.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ENmix
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ENmix
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ENmix/
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