ENmix

DOI:10.18129 / B9.bioc.ENmix

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见ENmix

Illumina DNA甲基化BeadChip的质量控制和分析工具

Bioconductor版本:3.13

Illumina DNA甲基化阵列的质量控制、分析和可视化工具包。

作者:徐宗礼[cre, aut],牛良[aut], Jack Taylor [ctb]

维护者:徐宗丽

引文(从R内,输入引用(“ENmix”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("ENmix")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ENmix”)

PDF R脚本 ENmix用户指南
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文本 新闻

细节

biocViews BatchEffectDNAMethylationDataImportDifferentialMethylation表观遗传学ImmunoOncologyMethylationArray微阵列多通道归一化OneChannel预处理PrincipalComponent质量控制回归软件TwoChannel
版本 1.28.8
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(6.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 平行,doParallelforeachSummarizedExperiment,统计数据
进口 grDevices、图形preprocessCorematrixStats,方法,utils,irrgeneplotter嫁祸于minfiRPMMilluminaiodynamicTreeCutIRangesgtoolsBiobaseExperimentHubAnnotationHubgenefiltergplotsquadprogS4Vectors
链接
建议 minfiDataRUnitBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 ENmix_1.28.8.tar.gz
Windows二进制 ENmix_1.28.8.zip
macOS 10.13 (High Sierra) ENmix_1.28.8.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ENmix
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ENmix
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ENmix/
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