肘

DOI:10.18129 / B9.bioc.ELBOW

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.13版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅肘。

手肘——评估褶皱变化分对数的方式

Bioconductor版本:3.13

手肘一种改进的褶皱变化测试,使用聚类分析和模式识别设置切断限制直接来自intrareplicate没有假定正态分布方差只有2生物复制。肘部也提供了跨平台的一致性一样折叠测试分析。肘部的假阳性和假阴性率低于标准折叠测试时都是评估使用T测试和统计分析微阵列使用12复制(六个复制每一个初始的和最终的条件)。肘部提供了一个null值基于初始条件复制并给出结果的误差范围,允许更好的评价意义。

作者:张祥立,娜塔莉·比约克隆德,格雷厄姆•Alvare汤姆Ryzdak,布莱恩Fristensky理查德•胡瓜鱼

维护人员:格雷厄姆Alvare < Alvare cc.umanitoba。ca >,祥立张< justinzhang。xl gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“肘部”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneExpression,ImmunoOncology,微阵列,多通道,OneChannel,RNASeq,测序,软件,技术,TwoChannel
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(7.5年)
许可证	文件许可
取决于	R (> = 2.15.0)
进口	图形、统计、跑龙套
链接
建议	DESeq,GEOquery,limmasimpleaffy,affyPLM,RColorBrewer,hgu133plus2cdf,hgu133plus2probe
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ELBOW
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/手肘
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ELBOW/
包下载报告	下载数据