DelayedArray

DOI:10.18129 / B9.bioc.DelayedArray

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DelayedArray。

一个统一的框架工作透明的磁盘和内存中的数组类数据集

Bioconductor版本:3.13

包装类似数组的对象(通常是一个磁盘对象)在DelayedArray对象允许一个执行常见的数组操作没有在内存中加载对象。为了减少内存使用和优化性能,操作对象或延迟执行使用一块处理机制。注意,这也适用于内存中的数组类的物品,例如DataFrame对象(通常用Rle列),矩阵对象,普通数组和,数据帧。

作者:< hpages.on Herve页面。github在gmail.com >,with contributions from Peter Hickey and Aaron Lun

维护人员:< hpages.on Herve页面。github在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DelayedArray”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“DelayedArray”)

PDF	R脚本	DelayedArray / HDF5Array更新
HTML		实现一个DelayedArray后端
PDF	R脚本	使用大型阵列在R
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,DataRepresentation,GenomeAnnotation,基础设施,软件
版本	0.18.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 4.0.0)、方法stats4,矩阵,BiocGenerics(> = 0.37.0),MatrixGenerics(> = 1.1.3),S4Vectors(> = 0.27.2),IRanges(> = 2.17.3)
进口	统计数据
链接	S4Vectors
建议	BiocParallel,HDF5Array(> = 1.17.12),genefilter,SummarizedExperiment,气道,lobstr,DelayedMatrixStats,knitr,rmarkdown,BiocStyle,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/DelayedArray
BugReports	https://github.com/Bioconductor/DelayedArray/issues
取决于我	DelayedDataFrame,DelayedMatrixStats,DelayedRandomArray,GDSArray,HDF5Array,restfulSE,rhdf5client,SCArray,singleCellTK,TileDBArray,VCFArray
进口我	后面;,beachmat,bigPint,BiocSingular,bsseq,篮球选手,celaref,celda,celldex,ChromSCape,clusterExperiment,compartmap,cytomapper,DEScan2,DropletUtils,DSS,埃尔默,flowWorkspace,弗雷泽,GenoGAM,GenomicScores,glmGamPoi,gramm4R,GSVA,hipathia,imcdatasets,LoomExperiment,mbkmeans,MethReg,methrix,methylSig,米娅,miaViz,minfi,MOFA2,mumosa,netSmooth,NewWave,PCAtools,ResidualMatrix,RTCGAToolbox,ScaledMatrix,嘘,scDblFinder,scMerge,scmeth,scPCA,食物,用水晶球占卜,天窗,signatureSearch,SingleCellExperiment,单,SummarizedExperiment,TSCAN,VariantExperiment,伶盗龙,weitrix,zellkonverter
建议我	BiocGenerics,ChIPpeakAnno,CNVgears,gwascat,iSEE,桅杆,S4Vectors,土星,SQLDataFrame,TrajectoryUtils
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	DelayedArray_0.18.0.tar.gz
Windows二进制	DelayedArray_0.18.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	DelayedArray_0.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DelayedArray
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DelayedArray
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DelayedArray/
包下载报告	下载数据