DegNorm

DOI:10.18129 / B9.bioc.DegNorm

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DegNorm

DegNorm:退化为RNA-seq数据规范化

Bioconductor版本:3.13

这个包执行退化正常化散装RNA-seq数据以改进微分表达式分析精度。

作者:王本熊和中正

维护人员:王中正大学< jzwang northwestern.edu >

从内部引用(R,回车引用(“DegNorm”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DegNorm”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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文本 新闻

细节

biocViews 对齐,BatchEffect,报道,DataImport,DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,归一化,质量控制,RNASeq,测序,软件
版本 1.2.0
Bioconductor自 BioC 3.12 (r - 4.0)(1年)
许可证 LGPL (> = 3)
取决于 R(> = 4.0.0)方法
进口 Rcpp(> = 1.0.2中),GenomicFeatures平行,foreach,S4Vectors,doParallel,Rsamtools(> = 1.31.2),GenomicAlignments,的热图,data.table统计数据,ggplot2,GenomicRanges,IRanges,plyr,情节跑龙套,冬青
链接 Rcpp,RcppArmadillo,S4Vectors,IRanges
建议 knitr,rmarkdown,formatR
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/jipingw/DegNorm/issues
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 DegNorm_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 DegNorm_1.2.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) DegNorm_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DegNorm
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DegNorm
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/DegNorm/
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