CoverageView

DOI:10.18129 / B9.bioc.CoverageView

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CoverageView。

覆盖率R可视化方案

Bioconductor版本:3.13

这个包提供了一个框架的可视化基因组覆盖率概要文件。它可以用于ChIP-seq实验,但它也可以用于全基因组核小体定位实验或其他类型的实验是很重要的有一个框架,以检查如何覆盖分布在整个基因组

作者:埃内斯托•罗伊

维护人员:埃内斯托罗伊< ernestolowy gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CoverageView”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“CoverageView”)

PDF	R脚本	简单的可视化的阅读范围
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,技术,可视化
版本	1.30.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(7.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 2.10),方法,Rsamtools(> = 1.19.17),rtracklayer
进口	S4Vectors(> = 0.7.21),IRanges(> = 2.3.23),GenomicRanges,GenomicAlignments、平行、工具
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CoverageView_1.30.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)	CoverageView_1.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CoverageView
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CoverageView
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CoverageView/
包下载报告	下载数据