CopyNumberPlots

DOI:10.18129 / B9.bioc.CopyNumberPlots

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见CopyNumberPlots．

使用核型分析仪功能创建拷贝数图

Bioconductor版本:3.13

CopyNumberPlots有一组扩展核型绘图功能的功能，可以创建漂亮的、可定制的和灵活的拷贝数相关数据图。

作者:Bernat Gel 和Miriam Magallon

维护者:Bernat Gel

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CopyNumberPlots”)

超文本标记语言	R脚本	CopyNumberPlots装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation,报道,DNASeq,DataImport,OneChannel,测序,软件,可视化
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.6)，karyoploteR
进口	地区,IRanges,Rsamtools,SummarizedExperiment,VariantAnnotation，方法，统计，GenomeInfoDb,GenomicRanges,cn.mops,rhdf5,跑龙套
链接
建议	BiocStyle,knitr,panelcn.mops,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked,DNAcopy,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/bernatgel/CopyNumberPlots
BugReports	https://github.com/bernatgel/CopyNumberPlots/issues
全靠我
进口我	CNVfilteR,CNViz
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CopyNumberPlots_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	CopyNumberPlots_1.8.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	CopyNumberPlots_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CopyNumberPlots
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CopyNumberPlots
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CopyNumberPlots/
软件包下载报告	下载数据