ComplexHeatmap
DOI:
10.18129 / B9.bioc.ComplexHeatmap
这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ComplexHeatmap。
使复杂的热图
Bioconductor版本:3.13
复杂的热图是有效的可视化不同来源的数据集之间的联系,揭示潜在的模式。这里ComplexHeatmap包提供了一个高度灵活的方式安排多个热图和支持各种注释图形。
作者:Zuguang顾
维护人员:Zuguang顾< z。顾在dkfz.de >
从内部引用(R,回车引用(“ComplexHeatmap”)
):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ComplexHeatmap”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ComplexHeatmap”)
细节
biocViews |
测序,软件,可视化 |
版本 |
2.8.0 |
Bioconductor自 |
BioC 3.1 (r - 3.2)(6.5年) |
许可证 |
麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 |
R(> = 3.5.0)、方法、网格,图形,统计,grDevices |
进口 |
circlize(> = 0.4.5),GetoptLong,色彩,线索,RColorBrewer,GlobalOptions(> = 0.1.0),png,开罗,消化,IRanges,matrixStats,foreach,doParallel |
链接 |
|
建议 |
testthat(> = 1.0.0),knitr,减价,dendsort,jpeg,tiff,fastcluster,EnrichedHeatmap,dendextend(> = 1.0.1),grImport,grImport2,胶水,GenomicRanges,gridtext,pheatmap(> = 1.0.12),gridGraphics,gplots |
SystemRequirements |
|
增强了 |
|
URL |
https://github.com/jokergoo/ComplexHeatmaphttps://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/ |
取决于我 |
意大利苦杏酒,EnrichedHeatmap,收回 |
进口我 |
airpart,BiocOncoTK,BioNERO,blacksheepr,BloodGen3Module,催化剂,celda,CeTF,可可,可乐,DEComplexDisease,DEGreport,部,diffcyt,diffUTR,埃尔默,fCCAC,GeneTonic,GenomicSuperSignature,gmoviz,InteractiveComplexHeatmap,InterCellar,iSEE,LineagePulse,MatrixQCvis,MesKit,现代艺术博物馆,马斯喀特,musicatk,MWASTools,PathoStat,PeacoQC,pipeComp,POMA,profileplyr,sechm,SEtools,simplifyEnrichment,singleCellTK,TBSignatureProfiler,TCGAWorkflow,Xeva,YAPSA |
建议我 |
阿尔卑斯山脉,artMS,bambu,BrainSABER,clustifyr,CNVRanger,dittoSeq,EnrichmentBrowser,gtrellis,HilbertCurve,msImpute,NanoporeRNASeq,projectR,scDblFinder,TCGAbiolinks,TCGAutils,TimeSeriesExperiment,weitrix |
我的链接 |
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构建报告 |
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包档案
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