ComplexHeatmap

DOI:10.18129 / B9.bioc.ComplexHeatmap

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ComplexHeatmap

使复杂的热图

Bioconductor版本:3.13

复杂的热图是有效的可视化不同来源的数据集之间的联系,揭示潜在的模式。这里ComplexHeatmap包提供了一个高度灵活的方式安排多个热图和支持各种注释图形。

作者:Zuguang顾

维护人员:Zuguang顾< z。顾在dkfz.de >

从内部引用(R,回车引用(“ComplexHeatmap”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ComplexHeatmap”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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HTML complex_heatmap.html
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PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 测序,软件,可视化
版本 2.8.0
Bioconductor自 BioC 3.1 (r - 3.2)(6.5年)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于 R(> = 3.5.0)、方法、网格,图形,统计,grDevices
进口 circlize(> = 0.4.5),GetoptLong,色彩,线索,RColorBrewer,GlobalOptions(> = 0.1.0),png,开罗,消化,IRanges,matrixStats,foreach,doParallel
链接
建议 testthat(> = 1.0.0),knitr,减价,dendsort,jpeg,tiff,fastcluster,EnrichedHeatmap,dendextend(> = 1.0.1),grImport,grImport2,胶水,GenomicRanges,gridtext,pheatmap(> = 1.0.12),gridGraphics,gplots
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/jokergoo/ComplexHeatmaphttps://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/
取决于我 意大利苦杏酒,EnrichedHeatmap,收回
进口我 airpart,BiocOncoTK,BioNERO,blacksheepr,BloodGen3Module,催化剂,celda,CeTF,可可,可乐,DEComplexDisease,DEGreport,,diffcyt,diffUTR,埃尔默,fCCAC,GeneTonic,GenomicSuperSignature,gmoviz,InteractiveComplexHeatmap,InterCellar,iSEE,LineagePulse,MatrixQCvis,MesKit,现代艺术博物馆,马斯喀特,musicatk,MWASTools,PathoStat,PeacoQC,pipeComp,POMA,profileplyr,sechm,SEtools,simplifyEnrichment,singleCellTK,TBSignatureProfiler,TCGAWorkflow,Xeva,YAPSA
建议我 阿尔卑斯山脉,artMS,bambu,BrainSABER,clustifyr,CNVRanger,dittoSeq,EnrichmentBrowser,gtrellis,HilbertCurve,msImpute,NanoporeRNASeq,projectR,scDblFinder,TCGAbiolinks,TCGAutils,TimeSeriesExperiment,weitrix
我的链接
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 ComplexHeatmap_2.8.0.tar.gz
Windows二进制 ComplexHeatmap_2.8.0.zip
macOS 10.13(高山脉) ComplexHeatmap_2.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ComplexHeatmap
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ComplexHeatmap
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ComplexHeatmap/
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