ClusterSignificance

DOI:10.18129 / B9.bioc.ClusterSignificance

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ClusterSignificance。

ClusterSignificance包提供了一些工具来评估如果类集群在维数降低数据表示有分离不同交换数据

Bioconductor版本:3.13

ClusterSignificance包提供了一些工具来评估如果类集群在维数降低数据表示有分离不同交换数据。术语类集群在这里指的是,集群的点代表已知类的数据。这是特别有用的来确定变量的子集,例如基因仅在特定的通路,可以将样本分为建立这些类。ClusterSignificance完成这个,所有的点投影到一维线。集群分离然后得分的概率出现分离是由于机会评估使用排列方法。

作者:杰森t、(aut (cre) Jesper r . Gadin (aut)

维护人员:杰森T、<杰森。、在ki.se >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ClusterSignificance”)

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文档

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HTML	R脚本	ClusterSignificance装饰图案
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文本		新闻

细节

biocViews	分类,聚类,PrincipalComponent,软件,StatisticalMethod
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(5.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.3.0)
进口	方法,pracma,princurve(> = 2.0.5),scatterplot3d,RColorBrewergrDevices,图形,跑龙套,统计数据
链接
建议	knitr,rmarkdown,testthat,BiocStyle,ggplot2,plsgenomics,covr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jasonserviss/ClusterSignificance/
BugReports	https://github.com/jasonserviss/ClusterSignificance/issues
取决于我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ClusterSignificance_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	ClusterSignificance_1.20.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	ClusterSignificance_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ClusterSignificance
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ClusterSignificance
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ClusterSignificance/
包下载报告	下载数据