CluMSID

DOI:10.18129 / B9.bioc.CluMSID

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CluMSID。

集群的代谢物鉴定一份光谱

Bioconductor版本:3.13

CluMSID艾滋病是一种工具,没有针对性的识别特性质/ MS分析通过使用一份光谱相似性和无监督的统计方法。它提供了功能完整的和可定制的工作流从原始数据到数据可视化和与xmcs interfaceable预处理方案的家庭。

作者:Tobias Depke (aut (cre) Raimo因特网(施),马克Broenstrup(黑色)

维护人员:Tobias Depke < tobias.depke在helmholtz-hzi.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CluMSID”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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细节

biocViews	聚类,代谢组学,预处理,软件
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(2.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.6)
进口	mzR,S4Vectors,dbscan,RColorBrewer,猿,网络,GGally,ggplot2,情节统计数据、方法、跑龙套,系统网络体系结构(sna)grDevices图形,Biobase,gplots,MSnbase
链接
建议	knitr,rmarkdown,testthat,dplyr,readr,stringr,magrittr,CluMSIDdata,metaMS,metaMSdata,xcms
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/tdepke/CluMSID
BugReports	https://github.com/tdepke/CluMSID/issues
取决于我
进口我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CluMSID_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	CluMSID_1.8.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	CluMSID_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CluMSID
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CluMSID
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CluMSID/
包下载报告	下载数据