ChromHeatMap

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChromHeatMap

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见ChromHeatMap．

基因组坐标绘制热图

Bioconductor版本:3.13

ChromHeatMap包可用于沿给定染色体的每条链绘制全基因组数据(例如，表达，CGH, SNP)作为热图。生成的热图可用于交互式地识别感兴趣的探针和基因。

作者:Tim F. Rayner

维护者:Tim F. Rayner

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("ChromHeatMap")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ChromHeatMap”)

PDF	R脚本	用ChromHeatMap绘制表达式数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	软件，可视化
版本	1.46.0
在Bioconductor	BioC 2.5 (R-2.10)(12年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.9.0)，BiocGenerics(> = 0.3.2),注释(> = 1.20.0),AnnotationDbi(> = 1.4.0)
进口	Biobase(>= 2.17.8)，图形，grDevices，方法，统计，IRanges，rtracklayer，GenomicRanges
链接
建议	所有，hgu95av2.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ChromHeatMap_1.46.0.tar.gz
Windows二进制	ChromHeatMap_1.46.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	ChromHeatMap_1.46.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChromHeatMap
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ChromHeatMap
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ChromHeatMap/
软件包下载报告	下载数据