ChIPComp

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIPComp

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见ChIPComp

多个ChIP-seq数据集的定量比较

Bioconductor版本:3.13

ChIPComp在考虑匹配控制的多种条件下检测差异结合的尖锐结合位点。

作者:吴浩,陈莉,秦朝晖,王驰

维护人员:李晨<李。陈在emory.edu>

引文(从R内,输入引用(“ChIPComp”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("ChIPComp")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ChIPComp”)

PDF R脚本 ChIPComp
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ChIPSeq报道DataImport遗传学MultipleComparison测序软件转录
版本 1.22.0
在Bioconductor BioC 3.2 (R-3.2)(6年)
许可证 GPL
取决于 R (>= 3.2.0),GenomicRangesIRangesrtracklayerGenomeInfoDbS4Vectors
进口 RsamtoolslimmaBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9BiocGenerics
链接
建议 BiocStyleRUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 ChIPComp_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 ChIPComp_1.22.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) ChIPComp_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIPComp
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ChIPComp
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ChIPComp/
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