红衣主教

DOI:10.18129 / B9.bioc.Cardinal

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅红衣主教。

统计分析的质谱影像工具箱

Bioconductor版本:3.13

实现统计和计算工具分析质谱影像数据集,包括有效的预处理方法、空间分割和分类。

作者:凯莉Bemis a < k。比northeastern.edu >

维修工:凯莉Bemis a < k。比northeastern.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“红衣主教”)

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文档

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browseVignettes(“红衣主教”)

HTML	R脚本	1。红衣主教2:用户指南进行质谱分析成像分析
HTML	R脚本	2。红衣主教2:质谱分析成像的统计方法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类,聚类,ImagingMassSpectrometry,ImmunoOncology,基础设施,Lipidomics,MassSpectrometry,归一化,蛋白质组学,回归,软件
版本	2.10.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	BiocGenerics,BiocParallel,EBImage、图形的方法,S4Vectors(> = 0.27.3),统计数据,ProtGenerics
进口	Biobase,dplyr,irlba,晶格,矩阵,事,magrittr,mclust,nlme平行,信号,spstats4跑龙套,viridisLite
链接
建议	BiocStyle,testthat,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cardinalmsi.org
取决于我	CardinalWorkflows
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Cardinal_2.10.0.tar.gz
Windows二进制	Cardinal_2.10.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	Cardinal_2.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Cardinal
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/红衣主教
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Cardinal/
包下载报告	下载数据