此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见CancerInSilico.
Bioconductor版本:3.13
CancerInSilico包提供了一个R接口,用于运行肿瘤进展的数学模型,并根据结果生成基因表达数据。这个包包含用c++实现的底层模型和用R实现的输出和分析特性。
作者:Thomas D. Sherman, Raymond Cheng, Elana J. Fertig
维护者:Thomas D. Sherman
引文(从R内,输入引用(“CancerInSilico”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" cancerinsilicon ")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“CancerInSilico”)
超文本标记语言 | R脚本 | CancerInSilico包 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | BiomedicalInformatics,CellBiology,GeneExpression,ImmunoOncology,MathematicalBiology,RNASeq,SingleCell,软件,SystemsBiology |
版本 | 2.12.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.4),Rcpp |
进口 | 方法,utils,图形,统计 |
链接 | Rcpp,黑洞 |
建议 | testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,Rtsne,冬青,rgl,gplots |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | CancerInSilico_2.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | CancerInSilico_2.12.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | CancerInSilico_2.12.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CancerInSilico |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CancerInSilico |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CancerInSilico/ |
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