CONSTANd

DOI:10.18129 / B9.bioc.CONSTANd

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CONSTANd。

标准化的数据矩阵斜

Bioconductor版本:3.13

由斜规范化数据矩阵的数据(使用RAS方法•巴卡洛克,见参考资料)Nrows由Ncols矩阵的行和列的方式意味着= 1。结果是一个规范化数据矩阵K = RAS,行mulipliers的产物“R”和列乘数的年代与原矩阵a。缺失的信息需要被视为“NA”值不为零值,因为CONSTANd能够忽略缺失值在计算的意思。使用CONSTANd标准化允许样本之间的直接比较值在同一个甚至跨不同CONSTANd-normalized数据矩阵。

作者:尤里斯Van Houtven aut,实验室,基尔特•简•咳嗽(trl),德克Valkenborg (aut (cre)

维护人员:德克Valkenborg <德克。在valkenborg uhasselt.be >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CONSTANd”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“CONSTANd”)

HTML	R脚本	CONSTANd
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	Cheminformatics,DifferentialExpression,遗传学,MassSpectrometry,归一化,预处理,蛋白质组学,软件,转录组
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(< 6个月)
许可证	文件许可证
取决于	R (> = 4.1)
进口
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,tidyr,ggplot2,gridExtra,魔法,开罗,limma
SystemRequirements
增强了
URL	qcquan.net/constand
BugReports	https://github.com/PDiracDelta/CONSTANd/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CONSTANd_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	CONSTANd_1.0.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	CONSTANd_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CONSTANd
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CONSTANd
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CONSTANd/
包下载报告	下载数据