萤石

DOI:10.18129 / B9.bioc.CAnD

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见萤石

执行染色体血统差异(CAnD)分析

Bioconductor版本:3.13

函数在一组祖先比例上执行CAnD测试。对于一个特定的祖先亚群体,用户将为每个样本和每个感兴趣的染色体或染色体段提供估计的祖先比例。每个染色体的p值以及每次测试的整体CAnD p值将返回。绘图功能也可用。

作者:凯特琳·麦克休,蒂莫西·桑顿

维护者:Caitlin McHugh

引文(从R内,输入引用(“萤石”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CAnD")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“萤石”)

PDF R脚本 利用“CAnD”包检测染色体间群体结构的异质性
PDF 参考手册

细节

biocViews GeneticVariability遗传学单核苷酸多态性软件StatisticalMethod
版本 1.24.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(6.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于
进口 方法,ggplot2重塑
链接
建议 RUnitBiocGenericsBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 CAnD_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 CAnD_1.24.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) CAnD_1.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CAnD
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CAnD
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/CAnD/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网