咖啡馆

DOI:10.18129 / B9.bioc.CAFE

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅咖啡馆。

Chromosmal畸变仪在表达数据

Bioconductor版本:3.13

检测和可视化总值的染色体畸变使用Affymetrix表达式微阵列作为输入

作者:桑德博伦

维护人员:桑德博伦< sander.h。博伦在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“咖啡馆”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“咖啡馆”)

PDF	R脚本	手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,GeneSetEnrichment,微阵列,OneChannel,软件
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(7.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10),biovizBase,GenomicRanges,IRanges,ggbio
进口	affy,ggplot2,注释、网格gridExtratcltk,Biobase
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CAFE_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	CAFE_1.28.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	CAFE_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CAFE
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/咖啡馆
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CAFE/
包下载报告	下载数据