BiocSet

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocSet

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见BiocSet．

代表不同的生物集

Bioconductor版本:3.13

BiocSet以三重tibble格式显示不同的生物集。这三个tibbles是' element '， ' set '和' elementset '。用户可以激活这三个tibble中的一个，以执行dplyr包中的通用功能。映射功能和访问元素/集的网络引用在bioset中也可用。

作者:Kayla Morrell [aut, cre]， Martin Morgan [aut]， Kevin Rue-Albrecht [ctb]， Lluís Revilla Sancho [ctb]

维护者:Kayla Morrell < Kayla。roswellpark.org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BiocSet”)

超文本标记语言	R脚本	BiocSet:表示Tidyverse中的元素集
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	去，GeneExpression，KEGG，软件
版本	1.6.1
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.6)，dplyr
进口	方法,宠物猫跑龙套,rlang，plyr，S4Vectors，BiocIO，AnnotationDbi，KEGGREST，ontologyIndex，tidyr
链接
建议	GSEABase，气道，org.Hs.eg.db，DESeq2，limma，BiocFileCache，GO.db，testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	RegEnrich
进口我
建议我	dearseq
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BiocSet_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	BiocSet_1.6.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	BiocSet_1.6.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocSet
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BiocSet
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocSet/
软件包下载报告	下载数据