BiocCheck

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocCheck

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BiocCheck。

Bioconductor-specific包检查

Bioconductor版本:3.13

执行Bioconductor-specific包检查。

作者:Bioconductor包维护者(aut (cre), Lori牧羊人(aut),丹尼尔·冯·Twisk[所有],凯文街(施),马塞尔•拉莫斯(施),莱昂纳多Collado-Torres[所有],费德里科•马里尼(施)

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BiocCheck”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BiocCheck”)

HTML	R脚本	BiocCheck:确保Bioconductor方案的指导方针
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施,软件
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(7.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	biocViews(> = 1.33.7),BiocManager,stringdist,图,httr、工具、optparse,codetools、方法、跑龙套knitr
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,Biobase,RJSONIO,rmarkdown,devtools(> = 1.4.1),usethis,BiocStyle
SystemRequirements
增强了	codetoolsBioC
URL	https://github.com/Bioconductor/BiocCheck/issues
取决于我
进口我	AnnotationHubData
建议我	GEOfastq,HMP16SData,HMP2Data,packFinder,preciseTAD,scp,scpdata,SpectralTAD
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BiocCheck_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	BiocCheck_1.28.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	BiocCheck_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocCheck
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BiocCheck
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocCheck/
包下载报告	下载数据