ArrayTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.ArrayTools

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.13版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅ArrayTools。

geneChip分析包

Bioconductor版本:3.13

这个包质量评估旨在提供解决方案和差异表达基因检测Affymetrix GeneChips,包括1.0 - 3 '借助于和基因阵列。HTML格式的包生成综合分析报告。报告页面上的超链接会导致一系列的QC情节,处理数据,差异表达基因列表。报告表格格式的差异表达基因注释超链接在线生物数据库。

作者:Xiwei吴,阿瑟·李

维修工:亚瑟·李在coh.org < xueli >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ArrayTools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	注释,DifferentialExpression,微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,ReportWriting,软件,StatisticalMethod,可视化
版本	1.52.0
Bioconductor自	BioC 2.3 (r - 2.8)(13岁)
许可证	LGPL (> = 2.0)
取决于	R (> = 2.7.0),affy(> = 1.23.4),Biobase(> = 2.5.5)方法
进口	affy,Biobase、图形、grDeviceslimma、方法、统计跑龙套,xtable
链接
建议	simpleaffy,R2HTML,affydata,affyPLM,genefilter,annaffy,gcrma,hugene10sttranscriptcluster.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ArrayTools
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ArrayTools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ArrayTools/
包下载报告	下载数据