结肠管制
doi：10.18129/b9.bioc.GenereRepulation
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅结肠管制。
通过序列匹配找到已知转录因子的候选结合位点
生物导体版本：3.12
转录因子蛋白（TFS）与基因转录起始位点上游（TSS）上游的DNA启动子区域的结合是最重要的机制之一，通过该机制，基因表达以及许多细胞过程得到控制。尽管近年来，许多新型数据已用于识别转录因子结合位点（TFBS） - 其中的ChIP-Seq和DNase I超敏反应区域 - 序列匹配继续起着重要作用。在此工作流程中，我们展示了使用模型有机体酿酒酵母在DNA序列中找到候选TF结合位点的生物导体技术。这里演示的方法同样适用于其他生物。
作者：生物导体软件包维护器[AUT，CRE]
维护者：bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用（从r内，输入引用（“基因管制”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ generewemulation”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“基因调节”）
| html | R脚本 | 通过序列匹配找到已知转录因子的候选结合位点 |
细节
| 生物浏览 | 表观遗传学，，，，工作流程 |
| 版本 | 1.14.0 |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.3.0），BSGENOME.SCEREVISIAE.UCSC.SACCER3，，，，生物弦，，，，GenomicFeatures，，，，主题，，，，S4VECTORS，，，，txdb.scerevisiae.ucsc.saccer3.sgdgene，，，，Motifstack，，，，org.sc.sgd.db，，，，seqlogo |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | //www.anjoumacpherson.com/help/workflows/generegulation/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | generegulation_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| MacOS 10.13（高山脉） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/generegulation |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/结节调节 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/generegulation/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
