eqtl

doi:10.18129/b9.bioc.eqtl

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅eqtl

具有生物导体GGTools 5.X

生物导体版本:3.12

该工作流程的重点是对CI中的EQTL搜索,因此测试了用于表达的基因的局部性DNA变体以进行缔合。

作者:Vincent Carey [AUT,CRE]

维护者:Vincent Carey

引用(从r内,输入引用(“ eqtl”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ eqtl”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ eqtl”)

html R脚本 具有生物导体GGTools 5.X

细节

生物浏览 GenomicVariantSworkFlow,,,,工作流程
版本 1.14.0
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.3.0),ggdata,,,,ggtools,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37,,,,Bibtex,,,,Biglm,,,,Data.Table,,,,多帕尔,,,,foreach,,,,编织,,,,Lumi,,,,Lumihumanall.db, 平行,rmeta,,,,STACTPLOT3D,,,,snpstats, 网格,yri1kgv
进口
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用
系统要求
增强
URL //www.anjoumacpherson.com/help/workflows/eqtl/
取决于我
进口我
建议我
链接到我

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 eqtl_1.14.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/eqtl
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/eqtl
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/eqtl/
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