该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅eqtl。
生物导体版本:3.12
该工作流程的重点是对CI中的EQTL搜索,因此测试了用于表达的基因的局部性DNA变体以进行缔合。
作者:Vincent Carey [AUT,CRE]
维护者:Vincent Carey
引用(从r内,输入引用(“ eqtl”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ eqtl”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ eqtl”)
html | R脚本 | 具有生物导体GGTools 5.X |
生物浏览 | GenomicVariantSworkFlow,,,,工作流程 |
版本 | 1.14.0 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.3.0),ggdata,,,,ggtools,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37,,,,Bibtex,,,,Biglm,,,,Data.Table,,,,多帕尔,,,,foreach,,,,编织,,,,Lumi,,,,Lumihumanall.db, 平行,rmeta,,,,STACTPLOT3D,,,,snpstats, 网格,yri1kgv |
进口 | |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com/help/workflows/eqtl/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | eqtl_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/eqtl |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/eqtl |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/eqtl/ |
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