- 首页
- Bioconductor 3.12
- 3.12工作流包
Bioconductor工作流包
Bioconductor版本:发布(3.12)
| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| 注释 | Bioconductor包维护者 | 基因组注释资源 |
| 数组 | Bioconductor包维护者 | 利用生物导体进行微阵列分析 |
| BiocMetaWorkflow | 迈克•史密斯 | BioC工作流关于发布BioC工作流 |
| BP4RNAseq | 令太阳 | 可重复的RNA-seq分析的保姆包 |
| CAGEWorkflow | 马尔特Thodberg | 使用R/Bioconductor分析笼内数据的一步一步指南 |
| chipseqDB | 亚伦Lun | 检测ChIP-seq数据中差异绑定的生物导体工作流程 |
| csawUsersGuide | 亚伦Lun | csaw用户指南 |
| cytofWorkflow | 马克·d·罗宾逊 | CyTOF工作流程:在高通量高维细胞术数据集的差异发现 |
| EGSEA123 | 马修·里奇 | 简易高效的EGSEA集成基因集测试 |
| eQTL | 文森特·凯里 | 使用Bioconductor GGtools 5.x进行云支持的cis-eQTL搜索 |
| ExpressionNormalizationWorkflow | Karthikeyan Murugesan | 基因表达规范化流程 |
| fluentGenomics | 斯图尔特•李 | 一个plyranges和txima工作流 |
| generegulation | Bioconductor包维护者 | 通过序列匹配找到已知转录因子的候选结合位点 |
| highthroughputassays | Bioconductor包维护者 | 使用高通量测定的生物导体 |
| liftOver | Bioconductor包维护者 | 使用rtracklayer::liftOver改变基因组坐标系统 |
| maEndToEnd | 斯蒂芬妮Reisenauer | 使用Affymetrix微阵列进行差异基因表达的端到端工作流程 |
| methylationArrayAnalysis | Jovana Maksimovic | 分析甲基化阵列数据的跨包生物导体工作流程。 |
| 蛋白质组学 | 劳伦特与 | 质谱和蛋白质组学数据分析 |
| recountWorkflow | 莱昂纳多Collado-Torres | 重新计算工作流程:使用Bioconductor访问超过70,000个人类RNA-seq样本 |
| RNAseq123 | 马修·里奇 | RNA-seq分析很容易，就像1-2-3与limma, Glimma和edgeR |
| rnaseqDTU | 迈克尔的爱 | 三文鱼定量后差异转录本使用的RNA-seq工作流程 |
| rnaseqGene | 迈克尔的爱 | RNA-seq工作流程:基因水平探索性分析和差异表达 |
| RnaSeqGeneEdgeRQL | Yunshun陈 | 基因水平RNA-seq差异表达和通路分析使用Rsubread和edgeR准似然管道 |
| 测序 | Bioconductor包维护者 | 序列数据的生物导体简介 |
| simpleSingleCell | 亚伦Lun | 使用Bioconductor对单细胞RNA-seq数据进行低级分析的逐步工作流程 |
| SingscoreAMLMutations | Dharmesh d Bhuva | 利用singscore从转录组特征预测AML突变 |
| TCGAWorkflow | 蒂亚戈Chedraoui席尔瓦 | TCGA工作流使用Bioconductor软件包分析癌症基因组学和表观基因组学数据 |
| 变体 | Bioconductor包维护者 | 注释的基因变异 |
包»
Bioconductor的稳定,每半年发布:
- 分析bob 体育平台下载 包。
- bob 体育平台下载 包。
- 说明bob 体育平台下载 包。
- bob 体育平台下载 包。
- 在线书籍。
- 最新的发布公告。
Bioconductor亦可透过码头工人和Amazon Machine Images。
Bioconductor(R)版本:
- 3.11 (4.0)
- 3.10 (3.6)
- 3.9 (3.6)
- 3.8 (3.5)
- 3.7 (3.5)
- 3.6 (3.4)
- 3.5 (3.4)
- 3.4 (3.3)
- 3.3 (3.3)
- 3.2 (3.2)
- 3.1 (3.2)
- 3.0 (3.1)
- 2.14 (3.1)
- 2.13 (3.0)
- 2.12 (3.0)
- 2.11 (2.15)
- 2.10 (2.15)
- 2.9 (2.14)
- 2.8 (2.13)
- 2.7 (2.12)
- 2.6 (2.11)
- 2.5 (2.10)
- 2.4 (2.9)
- 2.3 (2.8)
- 2.2 (2.7)
- 2.1 (2.6)
- 2.0 (2.5)
- 1.9 (2.4)
- 1.8 (2.3)
- 1.7 (2.2)
- 1.6 (2.1)
释放公告。
