该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅tximportdata。
生物导体版本:3.12
该软件包提供了在Geuvadis项目的6个RNA-Seq样本中运行各种转录物丰度量化符的输出。量词是袖扣,RSEM,Kallisto,鲑鱼和帆船。有关版本号,示例信息和通话详细信息的详细信息,请参阅软件包小插图。
作者:迈克尔·洛夫
维护者:迈克尔·洛夫(Michael Love)
引用(从r内,输入引用(“ tximportdata”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ tximportdata”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ tximportdata”)
html | R脚本 | tximport的示例输出文件 |
参考手册 |
生物浏览 | 实验数据,,,,rnaseqdata,,,,序列数据 |
版本 | 1.18.0 |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | |
进口 | |
链接 | |
建议 | 尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | deseq2,,,,鱼池,,,,人录取组成,,,,tximeta,,,,tximport,,,,方差分区 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | tximportData_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tximportdata |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/tximportdata |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/tximportdata/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |