tximportdata

doi:10.18129/b9.bioc.tximportdata

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅tximportdata

tximportdata

生物导体版本:3.12

该软件包提供了在Geuvadis项目的6个RNA-Seq样本中运行各种转录物丰度量化符的输出。量词是袖扣,RSEM,Kallisto,鲑鱼和帆船。有关版本号,示例信息和通话详细信息的详细信息,请参阅软件包小插图。

作者:迈克尔·洛夫

维护者:迈克尔·洛夫(Michael Love)

引用(从r内,输入引用(“ tximportdata”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ tximportdata”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ tximportdata”)

html R脚本 tximport的示例输出文件
PDF 参考手册

细节

生物浏览 实验数据,,,,rnaseqdata,,,,序列数据
版本 1.18.0
执照 GPL(> = 2)
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系统要求
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建议我 deseq2,,,,鱼池,,,,人录取组成,,,,tximeta,,,,tximport,,,,方差分区
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 tximportData_1.18.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tximportdata
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/tximportdata
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/tximportdata/
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