scRNAseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.scRNAseq

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见scRNAseq

公共单细胞RNA-Seq数据集的收集

Bioconductor版本:3.12

基因级计数用于公共scRNA-seq数据集的集合,作为singlecel实验对象提供细胞级和基因级元数据。

作者:Davide Risso [aut, cph], Michael Cole [aut], Aaron Lun [ctb, cre], Alan O'Callaghan [ctb], Jens Preussner [ctb], Charlotte Soneson [ctb], Stephany Orjuela [ctb]

维护者:Aaron Lun 的键盘

引文(从R内,输入引用(“scRNAseq”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("scRNAseq")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“scRNAseq”)

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文本 新闻

细节

biocViews ExperimentDataExperimentHubExpressionDataRNASeqDataSequencingDataSingleCellData
版本 测试盒框
许可证 CC0
取决于 SingleCellExperiment
进口 跑龙套、方法BiocGenericsS4VectorsGenomicRangesSummarizedExperimentExperimentHubAnnotationHubAnnotationDbiensembldbGenomicFeatures
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdownBiocFileCachetestthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 singleCellTK
建议我 后面;咆哮dittoSeqiSEEiSEEuscDblFinderscFeatureFilter司康饼食物天窗SingleCellExperiment一口SummarizedBenchmark伶盗龙zellkonverterzinbwave
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 scRNAseq_2.4.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scRNAseq
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scRNAseq
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/scRNAseq/
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