pathprintGEOData

DOI:10.18129 / B9.bioc.pathprintGEOData

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.12版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅pathprintGEOData。

通路指纹向量代表一个分段的数组地理数据存储库

Bioconductor版本:3.12

通路指纹向量已经预计算~ 390000公开数组从GEO语料库,横跨6种和31个平台。所有数据都伴随着相关的元数据。

作者:Gabriel Altschuler Sokratis Kariotis

维护人员:Sokratis Kariotis < s。在sheffield.ac.uk kariotis >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“pathprintGEOData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“pathprintGEOData”)

PDF	R脚本	pathprintGEOData
PDF		参考手册

细节

biocViews	Caenorhabditis_elegans_Data,Danio_rerio_Data,Drosophila_melanogaster_Data,ExperimentData,ExpressionData,地理,基因组,Homo_sapiens_Data,MicroarrayData,Mus_musculus_Data,OneChannelData,PathwayInteractionDatabase,Rattus_norvegicus_Data,SequencingData,TwoChannelData
版本	1.20.0
许可证	GPL
取决于	R (> = 3.4)
进口
链接
建议	pathprint,SummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	pathprint
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	pathprintGEOData_1.20.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pathprintGEOData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pathprintGEOData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pathprintGEOData/
包下载报告	下载数据