pasillaBamSubset

DOI:10.18129 / B9.bioc.pasillaBamSubset

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见pasillaBamSubset．

来自“Pasilla”实验的BAM文件子集

Bioconductor版本:3.12

BAM文件的子集。Bam(单端读取)和untreated3。bam(配对端读)来自“Pasilla”实验(Pasilla敲除布鲁克斯等人，基因组研究2011年)。请参阅pasilla数据包中的小插图，了解BAM文件如何untreated1。砰，没有治疗。bam从NCBI Gene Expression Omnibus提供的RNA-Seq读序列数据中获得，登录号为GSM461176至GSM461181。还包含苍蝇4号染色体的DNA序列，读取可以映射到。

作者:Hervé Pagès

维护者:Hervé Pagès

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" pasillabam子集")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	DNASeqData，ExperimentData，基因组，RNASeqData
版本	0.28.0
许可证	LGPL
取决于
进口
链接
建议	pasilla
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	GenomicAlignments，GenomicFeatures，GenomicRanges，gmoviz，IRanges，karyoploteR，plyranges，TransView
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	pasillaBamSubset_0.28.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pasillaBamSubset
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ pasillabam子集
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pasillaBamSubset/
软件包下载报告	下载数据