帕西拉
doi：10.18129/b9.bioc.pasilla
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅帕西拉。
Brooks等人的Pasilla敲除RNA-SEQ样品的数据包和人均读数，2011年基因组研究。
生物导体版本：3.12
该软件包提供了从RNA-seq数据中计算出的每个基因的每个读取计数，这些数据是在文章中介绍的，这些数据是“果蝇和哺乳动物之间RNA调节图的保存”，Brooks An，Yang L，Duff MO，Hansen，HansenKD，Park JW，Dudoit S，Brenner SE，Graveley BR，Genome Res。2011年2月; 21（2）：193-202，Epub 2010年10月4日，PMID：20921232。实验研究了pasilla的RNAi敲低的影响，果蝇果蝇的哺乳动物Nova1和Nova2的果蝇直系同源物对转录组。软件包小插图描述了此处提供的数据是如何从rna-seq读取序列数据中得出的，这些序列数据由NCBI基因表达式综合在登录号GSM461176到GSM461181提供。
作者：沃尔夫冈·胡伯（Alejandro Reyes）
维护者：Alejandro Reyes
引用（从r内，输入引用（“ pasilla”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ pasilla”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Pasilla”）
| html | R脚本 | 数据预处理和数据对象的pasillagenes和pasillaexons的创建 |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | Drosophila_melanogaster_data，，，，实验数据，，，，基因组，，，，rnaseqdata |
| 版本 | 1.18.1 |
| 执照 | LGPL |
| 要看 | r（> = 3.3.0） |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | dexseq，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，尼特 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | BlackSheepr |
| 建议我 | 坏人，，，，deseq，，，，deseq2，，，，dexseq，，，，增强的Volcano，，，，ihwpaper，，，，pasillabamsubset，，，，地区报告，，，，报告工具，，，，tidybulk |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | pasilla_1.18.1.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| MacOS 10.13（高山脉） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pasilla |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/pasilla |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/pasilla/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
