甲状旁腺
doi：10.18129/b9.bioc.parathyroidse
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅甲状旁腺。
Haglund等人，J Clin Clin Endocrinol Metab 2012的甲状旁腺原发性培养物RNA-seq的RANGEDSUMMARIZERIADSPERIMENT。
生物导体版本：3.12
该软件包提供了来自甲状旁腺肿瘤原发性培养物的实验中的基因和外显子零件中读数读数的范围内化对象。数据列于“甲状腺腺瘤中功能性雌激素受体的证据”，由Haglund F，Ma R，Huss M，Huss M，Sulaiman L，Lu M，Lu M，Nilsson IL，Hoog A，Juhlin CC，Juhlin CC，Hartman C，Hartman J，Larsson C，J，Larsson C，J，J，J。临床内分泌代替。JC.2012-2484，EPUB 2012年9月28日，PMID：23024189。在3个条件下（DPN，OHT和对照）对4例患者的肿瘤培养物进行测序。由于低质量，纸质作者省略了一个控制样本。软件包Vignette描述了NCBI基因表达式Omnibus在登录号GSE37211下提供的原始测序数据的创建。基因和外显子特征是GRCH37 ENEMBL注释。
作者：迈克尔·洛夫
维护者：迈克尔·洛夫（Michael Love）
引用（从r内，输入引用（“甲状旁腺”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“甲状旁腺”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
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Browsevignettes（“甲状旁腺”）
| R脚本 | 甲状旁腺 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 实验数据，，，，rnaseqdata，，，，序列数据 |
| 版本 | 1.28.0 |
| 执照 | LGPL |
| 要看 | 总结性特征，R（> = 2.10） |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | rsamtools，，，，基因组签名，，，，地球，，，，Sradb，，，，GenomicFeatures，，，，生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | 分类，，，，dexseq，，，，Simulatorz |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | 甲状旁腺甲_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| MacOS 10.13（高山脉） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/parathyroidse |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/甲状旁腺 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/parathyroidse/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
