leeBamViews

DOI:10.18129 / B9.bioc.leeBamViews

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见leeBamViews．

leeBamViews -多个酵母RNAseq样本摘自Lee 2009

Bioconductor版本:3.12

数据来自midid 19096707;用于管理多个NGS样本的原型

作者:VJ Carey

维护者:VJ Carey

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("leeBamViews")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“leeBamViews”)

PDF	R脚本	使用bamViews管理多个NGS样本
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData，RNASeqData，SNPData，Saccharomyces_cerevisiae_Data，SequencingData
版本	1.26.0
许可证	艺术2.0
取决于	R (>= 2.15.0)，Biobase，Rsamtools(> = 0.1.50),BSgenome
进口	GenomicRanges，GenomicAlignments、方法、S4Vectors平行,IRanges
链接
建议	biomaRt，org.Sc.sgd.db，刨边机
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	EDASeq
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	leeBamViews_1.26.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/leeBamViews
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/leeBamViews
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/leeBamViews/
软件包下载报告	下载数据