这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅gageData。
Bioconductor版本:3.12
这是一个支持软件包的数据包,计。然而,这里也有用基因提供的数据集或通路分析或微阵列数据分析。在这个方案中,我们提供两个演示微阵列数据集:GSE16873(乳腺癌从地理数据集)和BMP6(出版作为一个演示数据集计,也登记为GSE13604 GEO)。这个包还包括常用的基因集数据基于KEGG通路,主要研究物种,包括人类,老鼠,老鼠和出芽酵母。常见的出芽酵母基因IDs之间映射数据也包括在内。
作者:Weijun罗
维护人员:Weijun罗< luo_weijun yahoo.com >
从内部引用(R,回车引用(“gageData”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“gageData”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | BreastCancerData,CancerData,ExperimentData,地理,MicroarrayData,干细胞的 |
版本 | 2.28.0 |
许可证 | GPL (> = 2.0) |
取决于 | R (> = 2.10) |
进口 | |
链接 | |
建议 | 计,pathview,genefilter |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 计 |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | gageData_2.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13(高山脉) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gageData |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ gageData |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/gageData/ |
包下载报告 | 下载数据 |