裂变

DOI:10.18129 / B9.bioc.fission

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅裂变。

RangedSummarizedExperiment时间课程RNA-Seq裂殖酵母,以应对压力,由梁et al ., Nat Commun 2014。

Bioconductor版本:3.12

这个包提供了一个RangedSummarizedExperiment对象阅读数量基因的一段时间课程RNA-Seq实验裂殖酵母(粟酒裂殖酵母)的氧化应激反应(1米山梨糖醇治疗)(0)15、30、60、120和180分钟。样品都进一步划分为野生型组和一组atf21删除。阅读数矩阵研究的准备和提供的作者:梁HS,道森K, Wirth C,李Y, Connolly Y,史密斯DL,威尔金森CR,米勒CJ。“一个全球非编码RNA系统调节裂殖酵母蛋白质水平对压力的反应”。Nat Commun 2014年5月23日,5:3947。PMID: 24853205。地理:GSE56761。

作者:迈克尔的爱

维修工:迈克尔爱< michaelisaiahlove gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“裂变”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes(“裂变”)

HTML	R脚本	裂殖酵母时间进程
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData,地理,基因组,RNASeqData,Saccharomyces_cerevisiae_Data,SequencingData
版本	1.10.0
许可证	LGPL
取决于	R (> = 2.10),SummarizedExperiment
进口
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	rnaseqGene,ROCpAI
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	fission_1.10.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fission
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/裂变
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/fission/
包下载报告	下载数据