多萝西娅
doi：10.18129/b9.bioc.dorothea
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅多萝西娅。
人和老鼠TF规范的收集
生物导体版本：3.12
该软件包包含人类和鼠标TF调节。从不同类型的证据（例如文献资源，chip-seq峰，TF结合位点基序以及直接从基因表达推断出来的相互作用）中策划了人类规范并收集。小鼠的调节是通过将人类基因符号映射到小鼠的直系同源物中来构建的。这些规范可以与任何旨在分析基因集从基因表达数据中推断出TF活性的统计方法结合使用。最好使用统计方法毒蛇。
作者：克里斯蒂安·H·荷兰[CRE，AUT]
，Luz Garcia-Alonso [AUT]，Alberto Valdeolivas [CTB]，Minoo Ashtiani [CTB]，Attila Gabor [CTB]
维护者：gmail.com上的克里斯蒂安·H·荷兰
引用（从r内，输入引用（“ Dorothea”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ dorothea”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Dorothea”）
| html | R脚本 | TF活性推断，从散装转录组数据以多萝西亚为调节资源。 |
| html | R脚本 | 从scrna-seq数据中的TF活性推断，将多萝西亚作为调节资源。 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 实验数据，，，，homo_sapiens_data，，，，mus_musculus_data |
| 版本 | 1.2.2 |
| 执照 | GPL-3 +文件执照 |
| 要看 | R（> = 4.0） |
| 进口 | dplyr，，，，马格里特，，，，bcellviper，，，，毒蛇 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物酶，，，，生物使用，，，，尼特，，，，pheatmap，，，，pkgdown，，，，rmarkDown，，，，Seurat，，，，Singlecellexperiment，，，，总结性特征，，，，测试（> = 2.1.0），蒂布尔，，，，花花公子，UTILS |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://saezlab.github.io/dorothea/https://github.com/saezlab/dorothea |
| BugReports | https://github.com/saezlab/dorothea/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | 甲基 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | dorothea_1.2.2.2.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| MacOS 10.13（高山脉） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dorothea |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/dorothea |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/dorothea/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
