chipseqDBData

DOI:10.18129 / B9.bioc.chipseqDBData

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅chipseqDBData。

数据chipseqDB工作流

Bioconductor版本:3.12

排序和索引文件的BAM ChIP-seq库,用于chipseqDB工作流。BAM指标也包括在内。

作者:亚伦Lun (aut (cre)

维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“chipseqDBData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“chipseqDBData”)

HTML	R脚本	文件清单和统计
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeqData,ExperimentData,ExperimentHub,SequencingData
版本	1.6.0
许可证	CC 4.0
取决于
进口	AnnotationHub,ExperimentHub,Rsamtools,S4Vectors
链接
建议	knitr,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	chipseqDB,csawUsersGuide
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	chipseqDBData_1.6.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipseqDBData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ chipseqDBData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/chipseqDBData/
包下载报告	下载数据