RegParallel

DOI:10.18129 / B9.bioc.RegParallel

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见RegParallel．

R中的标准回归函数支持对大型数据帧进行并行处理

Bioconductor版本:3.12

在许多分析中，大量变量必须针对感兴趣的性状/终点进行独立测试，同时还需要对协变量和混杂因素进行调整。其中的主要瓶颈是完成这些分析所需的时间。使用RegParallel，可以同时执行大量测试。在一个12核系统上，可以同时测试144个变量，通过“嵌套”并行处理，可以在几秒钟内处理1000个变量。适用于逻辑回归，线性回归，条件逻辑回归，Cox比例风险和生存模型，以及贝叶斯逻辑回归。也适用于利用“survey”CRAN包创建的调查权重和利用“survey::svyglm”的广义线性模型。

作者:Kevin Blighe [aut, cre]， Sarega Gurudas [ctb]， Jessica Lasky-Su [aut]

维护者:Kevin Blighe < Kevin at clinicalbioinformatics.co.uk>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("RegParallel")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“RegParallel”)

超文本标记语言	R脚本	R中的标准回归函数支持对大型数据帧进行并行处理
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DiseaseModel，ExperimentData
版本	1.8.0
许可证	GPL-3
取决于	doParallel，foreach平行,迭代器，data.table，stringr，生存，手臂，统计，utils，方法
进口
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，knitr，DESeq2，气道，magrittr，Biobase，GEOquery，biomaRt，survminer，调查
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/kevinblighe/RegParallel
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	RegParallel_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RegParallel
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RegParallel
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RegParallel/
软件包下载报告	下载数据