RTCGA.rnaseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.RTCGA.rnaseq

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RTCGA.rnaseq。

从癌症基因组图谱项目Rna-seq数据集

Bioconductor版本:3.12

从癌症基因组图谱项目包提供rna-seq数据集的所有群组类型http://gdac.broadinstitute.org/。Rna-seq数据格式解释这里https://wiki.nci.nih.gov/display/TCGA/RNASeq +版本+ 2。数据源是illumina公司hiseq三级RSEM规范化表达数据。2015-11-01的数据快照。

作者:戈辛斯<一下。辛斯gmail.com >

维修工:戈辛斯<一下。辛斯gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RTCGA.rnaseq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“RTCGA.rnaseq”)

HTML	R脚本	使用RTCGA下载RNAseq数据包含在RTCGA.rnaseq
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释数据,ExperimentData
版本	20151101.20.0
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.2.0),RTCGA
进口
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/RTCGA/RTCGA/issues
取决于我
进口我
建议我	RTCGA
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RTCGA.rnaseq_20151101.20.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RTCGA.rnaseq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RTCGA.rnaseq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RTCGA.rnaseq/
包下载报告	下载数据