RTCGA.CNV

DOI:10.18129 / B9.bioc.RTCGA.CNV

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RTCGA.CNV。

CNV(人类基因组变异)数据集从癌症基因组图谱项目

Bioconductor版本:3.12

包提供CNV(基于合并snp)数据集的所有人群的癌症基因组图谱项目类型从http://gdac.broadinstitute.org/。数据格式是解释这里https://wiki.nci.nih.gov/display/TCGA/Retrieving +数据+使用+ +数据+矩阵。2015-11-01的数据快照。

作者:Przemyslaw Biecek < Przemyslaw。在gmail.com biecek >

维修工:戈辛斯<一下。辛斯gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RTCGA.CNV”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“RTCGA.CNV”)

HTML	R脚本	使用RTCGA CNV数据包含在RTCGA.CNV下载
HTML	R脚本	使用RTCGA的估计比MDM2的复制
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AnnotationData,ExperimentData
版本	1.18.0
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.3.0),RTCGA
进口
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/RTCGA/RTCGA/issues
取决于我
进口我
建议我	RTCGA
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RTCGA.CNV_1.18.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RTCGA.CNV
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RTCGA.CNV
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RTCGA.CNV/
包下载报告	下载数据