MetaGxPancreas

DOI:10.18129 / B9.bioc.MetaGxPancreas

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MetaGxPancreas。

胰腺癌转录组数据集

Bioconductor版本:3.12

胰腺癌转录组数据集的集合,是MetaGxData计划纲要的一部分。这个包包含多个胰腺癌症数据集,从各种资源下载,变成SummarizedExperiment对象。作者如何规范化数据的细节可以在实验数据的对象。此外,位置可以找到的数据得到的url变量实验数据部分每个SE。

作者:迈克尔·佐恩(aut (cre),这个镇Sandhu (aut),本杰明Haibe-Kains (aut)

维修工:迈克尔Zon < michaelzon7 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MetaGxPancreas”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MetaGxPancreas”)

HTML	R脚本	MetaGxPancreas:一个包胰腺癌基因表达分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ArrayExpress,CancerData,ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,地理,Homo_sapiens_Data,MicroarrayData,NCI,SequencingData
版本	1.10.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	SummarizedExperiment,ExperimentHubR (> = 3.6.0)
进口	统计数据,嫁祸于,S4Vectors,AnnotationHub
链接
建议	testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MetaGxPancreas_1.10.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MetaGxPancreas
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MetaGxPancreas
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MetaGxPancreas/
包下载报告	下载数据