MMAPPR2data

DOI:10.18129 / B9.bioc.MMAPPR2data

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MMAPPR2data。

MMAPPR2样本数据

Bioconductor版本:3.12

MMAPPR2包中包含的数据演示目的,即模拟BAM文件包含RNA-Seq数据slc24a5基因的突变,取自GRCz11基因组。还包含参考序列和注释文件。

作者:凯尔·约翰森(aut),乔纳森·希尔(cre)

乔纳森·希尔在byu.edu < jhill维护者:>

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MMAPPR2data”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MMAPPR2data”)

HTML	R脚本	使用MMAPPR2data资源
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	Danio_rerio_Data,ExperimentData,基因组,RNASeqData,SequencingData
版本	1.4.0
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6.0)
进口	Rsamtools
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle,roxygen2,seqinr,readr
SystemRequirements
增强了	MMAPPR2
URL	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3613585/https://github.com/kjohnsen/MMAPPR2
取决于我
进口我
建议我	MMAPPR2
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MMAPPR2data_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MMAPPR2data
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MMAPPR2data
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MMAPPR2data/
包下载报告	下载数据