IHWpaper

DOI:10.18129 / B9.bioc.IHWpaper

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见IHWpaper．

在IHW纸上复制数字

Bioconductor版本:3.12

这个包方便地包装了在IHW论文(https://www.nature.com/articles/nmeth.3885)和最新的arXiv预印本http://arxiv.org/abs/1701.05179中再现数字所需的所有功能。因此，它是Bioconductor IHW包的配套包。

作者:Nikos Ignatiadis [aut, cre]

维护者:Nikos Ignatiadis < Nikos。Ignatiadis01在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("IHWpaper")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“IHWpaper”)

超文本标记语言	R脚本	NMeth论文:解释tdr
超文本标记语言	R脚本	论文:IHW-Bonferroni模拟
超文本标记语言	R脚本	NMeth论文:真实数据示例
超文本标记语言	R脚本	NMeth论文:仿真图
超文本标记语言	R脚本	论文:分层直方图
超文本标记语言	R脚本	统计论文:IHW-Benjamini-Yekutieli的hQTL分析
超文本标记语言	R脚本	各种:BH解释/可视化
超文本标记语言	R脚本	各种:应用于IHW的Grenander估计器(vs ECDF)
超文本标记语言	R脚本	各种:真实数据示例:1倍权重函数
超文本标记语言	R脚本	各种:tdr和pvalue拒绝区域
超文本标记语言	R脚本	各种:权重vs独立过滤
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData，ExpressionData，RNASeqData，ReproducibleResearch
版本	1.18.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.3)，IHW
进口	Rcpp，统计，样条，方法，utils，DESeq2，SummarizedExperiment，fdrtool，genefilter，qvalue，Biobase，BiocGenerics，BiocParallel，dplyr、网格ggplot2，cowplot
链接	Rcpp
建议	testthat，RColorBrewer，wesanderson，尺度，gridExtra，BiocStyle，knitr，rmarkdown，气道，pasilla，DESeq，locfdr，tidyr，ggbio，latex2exp
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	IHWpaper_1.18.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IHWpaper
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/IHWpaper
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/IHWpaper/
软件包下载报告	下载数据