HMP16SData

DOI:10.18129 / B9.bioc.HMP16SData

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅HMP16SData。

从人类微生物组16 s rRNA测序数据项目

Bioconductor版本:3.12

HMP16SData是Bioconductor ExperimentData包人类微生物组的项目(HMP) 16 s rRNA测序数据变量地区1 - 3和3 - 5。原始数据文件提供的包从HMP下载数据分析和协调中心。处理过的数据是通过ExperimentHub SummarizedExperiment类对象。

作者:卢卡斯希弗<希弗。卢卡斯在gmail.com >,Rimsha Azhar , Marcel Ramos , Ludwig Geistlinger , Levi Waldron

维护人员:卢卡斯希弗<希弗。卢卡斯在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“HMP16SData”)

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文档

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HTML	R脚本	HMP16SData
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,Homo_sapiens_Data,MicrobiomeData,ReproducibleResearch,SequencingData
版本	1.10.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.0.0),SummarizedExperiment
进口	AnnotationHub,为了,dplyr,ExperimentHub,kableExtra,knitr,magrittr、方法、readr,S4Vectors,stringr,宠物猫,跑龙套
链接
建议	Biobase,BiocCheck,BiocManager,BiocStyle,circlize,covr,cowplot,curatedMetagenomicData,dendextend,devtools,ggplot2,gridExtra,还,phyloseq,rmarkdown,roxygen2统计数据,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/waldronlab/HMP16SData
BugReports	https://github.com/waldronlab/HMP16SData/issues
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包档案

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源包	HMP16SData_1.10.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HMP16SData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HMP16SData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HMP16SData/
包下载报告	下载数据